纽约市最东端的皇后区的历史可以追溯到殖民地时代之后。 在地理上它是长岛的一部分，并且是美洲原住民Lenape人的家。
英国和荷兰殖民者来到1635年定居的皇后区，1640年代在Maspeth和Vlissingen（现在的法拉盛）定居。 它是新荷兰殖民地的一部分。
1657年，法拉盛的殖民者签署了所谓的“法拉盛抗议活动”，这是美国宪法关于宗教自由条款的前身。
该文件抗议荷兰殖民政府对贵格会的迫害。
皇后郡 - 因为它在英国统治下被称为 - 是纽约的原始殖民地，于1683年创建。当时的县包括现在的拿骚县。
在革命战争期间，皇后区一直处于英国占领之下。 长岛战役大多发生在布鲁克林附近，皇后在战斗中扮演了一个小角色。
在19世纪，该地区仍然是农业。 1870年长岛市成立，从纽敦镇（现在的艾姆赫斯特）分离出来。
女王加入纽约市
作为纽约市的一部分，皇后区自1898年1月1日成立。同时，领土的东部 - 北亨普斯特德镇，牡蛎湾镇和大多数亨普斯特德镇依然存在作为皇后郡的一部分，但不是新的自治市镇。 一年后的1899年，他们分裂成为拿骚县。
接下来的几年是由新的交通路线定义的，并改变了困倦的自治市镇。 Queensborough大桥于1909年开放，1910年在East River下建成一条铁路隧道.IRT法拉盛地铁线路于1915年将皇后区与曼哈顿连接起来。这加上汽车的崛起促成了皇后区人口在不到10年的时间里翻了一番1920年的500,000到1930年的超过100万。
皇后在1939年纽约世界博览会的场地以及1964-65年在纽约世界博览会的场地都有聚光灯，都在法拉盛草地 - 科罗纳公园 。
拉瓜迪亚机场于1939年开业，1948年在肯尼迪 机场开业。当时它被称为Idlewild机场。
1971年，皇后成为流行文化中已知的数量作为Archie Bunker的家乡自治区在All in the Family中的地位。具有里程碑意义的sit-com电视节目是为了更好或更差地定义自治市镇。 最近一年来自皇后的演员已经上升到了名流的位置，特别是在Run DMC，Russell Simmons和50 Cent等嘻哈世界。
20世纪70年代至2000年代是皇后区历史上出现的另一个故事，因为伟大的美国移民体验向世界开放。 1965年的“移民和国籍法”从全世界开始合法移民。 皇后区已成为移民的目的地，一半以上的人口出生在海外，有超过一百种语言。
在2000年代，皇后被悲剧所打动。 9/11袭击袭击了整个行政区的居民和急救人员。 2001年11月美国航空公司第587航班坠毁在Rockaways，造成265人死亡。
2012年10月超级风暴桑迪摧毁了皇后区南部的低洼地区。 在暴风雨之后，一场大规模的火灾席卷了微风点附近，摧毁了一百多所房屋。